La Sección de Cirugía Torácica es parte de la División de Cirugía de la Escuela de Medicina desde la década del 90.
En un principio la cirugía cardiaca y torácica eran realizadas por un mismo grupo, hasta 1989, en que incorpora un cirujano torácico exclusivo, marcando el inicio de la subespecialidad como un grupo independiente. Posteriormente, en la década del 2000, se integran 2 nuevos cirujanos formados en la institución y con especialización en el extranjero.
Desde entonces la sección ha estado formada por cirujanos, que hacen docencia en pregrado y participan activamente en la formación de los residentes del programa de Cirugía General.