La sección de Cirugía Pediátrica fue creada en 1990 para cubrir la necesidad de tratamiento de dolencias infantiles quirúrgicas. Hoy en día se operan más de 1000 niños al año.
La Sección de Cirugía Pediátrica de la División de Cirugía de la Escuela de Medicina, está inserta dentro de la actividad docente de la Facultad de Medicina participando activamente en la docencia de Pre y Post grado a través de clases, cursos, seminarios y tutorías personales. Además, trabaja en estrecha colaboración con el Departamento de Pediatría en la evaluación, tratamiento y recuperación de los pacientes pediátricos sometidos a cirugía.
Los primeros alumnos de la Facultad de Medicina de la Pontificia Universidad Católica de Chile efectuaban sus estudios de pre grado en pediatría y cirugía de niños en conjunto con los alumnos de la Universidad de Chile. Esta situación se mantuvo hasta 1954, año en que se creó por decreto de rectoría, la Cátedra de Pediatría de la Pontificia Universidad Católica de Chile, con sede en el Hospital Manuel Arriarán.
En 1962 se traslada la Cátedra de Pediatría Servicio de Pediatría del Hospital Roberto del Río y en 1970 se crea el Departamento de Pediatría en el Hospital Dr. Sótero del Río. La Cirugía y Ortopedia Infantil continuaron en el Hospital Roberto del Río. En 1977 se crea el Servicio de Pediatría del Hospital Josefina Martínez de Ferrari.
Durante 1988 se logra el traslado de la docencia de alumnos e internos en Cirugía Pediátrica y Ortopedia al Hospital Josefina Martínez, constituyéndose como Unidad Docente Asociada. Se mantiene en ese establecimiento hasta 1990, trasladándose finalmente al Servicio de Pediatría en el Hospital Clínico UC
Luego de la reorganización experimentada por la Facultad durante 1993, la Cirugía Pediátrica se transforma en una Sección de la División de Cirugía.
